於地震後一直與外界失去聯絡的臥龍大熊貓保護中心，終透過衛星視像電話與四川省林業廳聯絡，報告其圈養的86隻熊貓全部無傷亡，幼子已全部送往地勢開闊安全的沙灣。而成都及雅安基地共68隻熊貓，以及陝西省珍稀野生動物搶救飼養研究中心的76隻熊貓亦同樣安全，林業局已要求各中心，加強震後設備的檢查，防止餘震傷害。

不過專家卻擔心，熊貓的主要食糧竹葉供應源出現問題，因為竹葉的產地主要是汶川、崇州及彭州等地，這些地方均受到地震影響，「大熊貓吃的竹葉一定要新鮮，供應要及時，否則大熊貓就要捱餓。」而成都大熊貓基地已與供應商聯繫，保證竹葉食源不出問題。另基地水電源已做了兩手準備，自備發電機，保證電源，確保不會斷水。至於逾1590隻野生大熊貓，因棲息地亦受地震波及，故牠們的狀?仍有待觀察。